University of California-Berkeley

UC Berkeley Researchers Accelerate DNA Sequencing

Data storage performance improvements provide university researchers critical flexibility.

Summary

University of California-Berkeley researchers employ the latest tools built on Apache Spark to accelerate DNA sequencing in pursuit of precision medicine. Adding Pure FlashBlade™ from Pure Storage® has significantly reduced the time needed to sequence data-intensive DNA samples and analyze results.

Industry

  • Healthcare

GEO

  • North America

Use Cases

  • Data Analytics – Apache Spark®

Website

Challenges

The university had the following challenges before choosing Pure Storage.

  • Exponential increases in the volume of genomic data demanded new approaches to high-performance data storage. 
  • Needed to rethink the genome sequencing process.
  • Adding storage capacity required unacceptably large capital outlays and downtime.

Results

Business Transformation

Researchers and clinicians can sequence a greater volume of DNA samples in far less time, generating valuable new insights and, in some cases, delivering faster answers to life-and-death questions.

IT Transformation

  • Load times for a critical sequencing index accelerated by 3x.
  • Decoupling of storage from compute engines simplifies the addition of storage capacity, delivering agility needed for production workflow while lowering cost.
  • Multiple types of data workflows supported concurrently with no impact on performance, giving researchers critical flexibility to explore a broader range of questions.

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간단한 3단계 절차로 시작하세요.

1. 스토리지 요구사항 검토

퓨어스토리지 전문가들에게 연락해 스토리지 요구사항에 대한 평가를 받아보세요.

2. POC 실행

퓨어스토리지 전문가와 협력을 통해 퓨어스토리지 제품 적합성을 증명하기 위한 PoC를 실시하세요.

3. 퓨어스토리지로의 마이그레이션 진행

퓨어스토리지 전문가와 협력하여 퓨어의 제품으로 마이그레이션해 총소유비용(TCO)을 절감시키세요.