University of California-Berkeley

加州大學柏克萊分校的研究員加速 DNA 定序工作

資料儲存的效能提升,讓研究人員有最大的彈性探索更多更為廣泛的議題

概要

加州大學柏克萊分校研究人員使用以 Apache Spark 為基礎的最新工具加速 DNA 定序,追求精密醫學。引進 Pure Storage® 的 Pure FlashBlade™ 顯著地縮短了對大量 DNA 樣本資料進行定序以及分析結果的時間。

產業

  • 醫療保健

GEO

  • 北美

使用案例

  • 資料分析 – Apache Spark®

網站

挑戰

在選擇Pure Storage前,柏克萊面臨了以下的挑戰

  • 必須以新的方式提供高效能的儲存設備以應付基因組資料量指數性的成長。 
  • 必須重新思考基因組定序的流程。
  • 大量的資金需求與停機時間使儲存容量難以提升。

成果

商業轉型

研究與醫療人員可以在更短的時間內定序更多的 DNA 樣本,對其獲得進一步的認識,有時甚至可以加速解決攸關生死的難題。

IT 轉型

  • 關鍵定序索引的讀取速度加快了 3 倍。
  • 將運算引擎與儲存設備分開,簡化容量增購的手續,提供作業流程所需的敏捷性並且降低開支。
  • 支援多種工作流程並行運作,且無損效能,讓研究人員有最大的彈性探索更多更為廣泛的議題。

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