Quand la performance du stockage aide à sauver des vies

L'analyse génomique possède un grand potentiel pour sauver des vies. Afin d'accélérer les analyses, et ainsi les diagnostics et les traitements, l'hôpital français AP-HM a centralisé ses travaux dans un biogénopôle doté d'une infrastructure rapide dont le stockage des données est assuré par du matériel Pure Storage.

L'Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (AP-HM) est l'un des plus grands hôpitaux universitaires de France. Avec plus de 2 000 médecins et plus de 12 000 personnels non médicaux, l'AP-HM propose une large gamme de services médicaux et chirurgicaux. L'établissement se distingue également par son engagement dans l'innovation et la recherche médicale, en particulier dans le domaine de la biologie moléculaire. L'AP-HM gère 1 600 programmes de recherche clinique et près de 12 000 patients en essais cliniques.

Qu'il s'agisse de diagnostiquer une maladie rare, de personnaliser un traitement anticancéreux ou de lutter contre une épidémie émergente, la rapidité des analyses de biologie moléculaire, y compris génomiques, est essentielle. Elle permet aux médecins d'intervenir plus rapidement et avec plus de précision, ce qui peut parfois faire la différence entre la vie et la mort.

Pour améliorer les performances de l'analyse génomique, l'AP-HM a mis en place un biogénopôle afin de centraliser la recherche biologique et les laboratoires sur un seul site.

« Nous réalisions des analyses sur plusieurs sites, chacun disposant de son propre stockage et de machines virtuelles VMware (VM) fonctionnant depuis deux centres de données », explique Renaud Massé, responsable de l'infrastructure informatique à l'AP-HM. « Dans un domaine où le temps est un facteur décisif, nous avions besoin de consolider les ressources et d'améliorer les performances. Nous avons décidé de créer une architecture centralisée dédiée aux activités de génomique. »

L'AP-HM utilisait déjà Pure Storage FlashArray//X et FlashArray//C pour le stockage général et la protection des données. L'assistance proactive, la facilité de gestion et les performances de Pure Storage se sont imposées. « Pure Storage nous a fourni d'excellentes performances et capacités au meilleur coût », déclare M. Massé.

Lors de la construction de l'infrastructure destinée à alimenter le Biogénopôle, l'AP-HM a voulu tirer parti de la cohérence de la plate-forme Pure Storage et a opté pour une démonstration de faisabilité (PoC) FlashBlade. Pure a fourni une baie FlashBlade dans une configuration de production, permettant à l'AP-HM de tester les performances en conditions réelles pendant trois mois. Pendant cette période, les équipes de Pure Storage ont aidé les bioinformaticiens de l'AP-HM à optimiser l'ensemble de l'infrastructure et le paramétrage des logiciels.

L'équipe de l'AP-HM a immédiatement constaté des gains de performance spectaculaires après le déploiement de cette infrastructure dédié à cette activité utilisant Pure Storage pour le stockage. Alors que les bioinformaticiens mettaient auparavant 11 heures en moyenne pour effectuer une analyse génomique, il ne leur faut plus que 4 heures -- soit 75 % plus vite.

« Nous pouvons attribuer les sept heures que nous avons gagnées dans la réalisation des analyses génomiques aux performances de la plateforme de calcul utilisant les technologies Pure Storage. Cela représente bien plus que des chiffres : Cela permet d'accélérer les diagnostics et de sauver des vies », souligne M. Massé.

Modèle de performance et d'efficacité opérationnelle, le biogénopôle de l'AP-HM se distingue également par sa durabilité. La plateforme Pure Storage a permis de réduire l'encombrement du stockage de 26U à 6U, soit une réduction de 77 %, ce qui a également contribué à réduire la consommation d'électricité d'environ 30 %.

Au-delà de ces chiffres impressionnants, c'est un tout nouvel horizon de possibilités qui s'ouvre à l'AP-HM. Grâce à cette infrastructure performante et évolutive, l'AP-HM dispose désormais d'une capacité d'analyse sans précédent, capable de s'adapter aux défis futurs. Cette flexibilité technologique contribue à placer l'AP-HM à l'avant-garde d'une médecine où l'analyse rapide est un puissant catalyseur d'espoir, offrant un nouveau potentiel pour sauver des vies.